教廷雖為主權獨立之國家，但其存在乃建立在全世界教友之信仰基礎上，其政治制度不同於一般世俗國家。中樞組織以輔助教宗管理普世教會及傳播福音為主。
教廷於2022年6月5日正式實施宗座憲章《你們去宣講福音》（Praedicate Evangelium），此憲章取代教宗若望•保祿二世於1988年公佈的《善牧》（Pastor Bonus）憲章。
教宗為管理普世教會，設立下列機構：
一、 國務院（Segreteria di stato）是教宗秘書處（Segreteria papale）：綜理教廷行政、外交，並掌理教宗之樞密事務，其首長為國務院長，現任國務院長為義大利籍之帕洛林樞機主教（Cardinal Pietro Parolin）， 帕洛林樞機主教係由教宗方濟各於2013年8月31日任命，並於當年10月15日就職。國務院下設一般事務（第一部門，等同內政部）、國際關係對外事務（第二部門，等同外交部）及教廷外交人員(第三部門)等三個部門。
一般事務部由國務院副院長主司其責，副院長為帕拉總主教(Archbishop Edgar Peña Parra, 2018年10月15日履職), 國際關係對外事務部由葛拉格總主教（Archbishop Paul R. Gallagher）負責、教廷外交人員部由Archbishop Jan Romeo Pawlowski總主教負責。
二、教廷內現有16個部會，自2022年6月5日配合憲政，部會統稱為Dicastery。
福音傳播部(Dicastery for Evangelization)
信仰教義部(Dicastery for the Doctrine of the Faith)
愛德服務部(Dicastery for the Service of Charity)
東方教會部(Dicastery for the Eastern Churches)
聖事禮儀部(Dicastery for Divine Worship and the Discipline of the Sacraments)
封聖部(Dicastery for the Causes of Saints)
主教部(Dicastery for Bishops)
聖職部(Dicastery for the Clergy)
修會和使徒生活團體聖部(Dicastery for Institutes of Consecrated life and Societies of Apostolic Life)
平信徒、家庭和生命部(Dicastery for the Laity, the Family and Life)
促進基督徒合一部(Dicastery for Promoting Christian Unity)
宗教對話部(Dicastery for Interreligious Dialogue)
文化教育部(Dicastery for Culture and Education)
促進人類整體發展部(Dicastery for Promoting Integral Human Development)
法典條文解釋部(Dicastery for Legislative Texts)
傳播部(Dicastery for Communication)
三、財政機關：經濟委員會、經濟秘書處、宗座遺產管理處、審計室、機密資金委員會及投資委員會。
四、事務局：教宗府、禮儀事務辦公室及總務事務局。
五、學術機構：聖座檔案室、聖座圖書館、聖伯多祿大殿、聖座考古委員會、聖座外交學院等。
司法機關
三個法院（Tribunals），分別為聖赦院、最高法院、聖輪法院。
元首
方濟各（His Holiness Pope Francis） （2013年3月13日當選、3月19日就任）。
教廷與184個國家建立外交關係（不含歐盟及馬爾他騎士團），其中91個國家在教廷派駐大使（包括歐盟、馬爾他騎士團；另阿拉伯國家聯盟、國際移民組織、聯合國難民事務高級專員辦公室在教廷派有代表），餘則為兼使。教廷為維護其獨立性，不成文規定各國駐義大利大使不得兼任駐教廷大使，反之亦然。教廷在184個建交國共派駐106位常駐專使，專使中有兼轄數個國家者；另在駐聯合國紐約總部、日內瓦辦事處派駐常任觀察員，教廷使節同時為教宗派在當地之教會代表，負責增進教廷與當地教會之聯繫，以及教廷與駐在國政府之關係；在部分國家或地區，則派有「宗座代表」，負責與當地教會之聯繫；在國際組織方面，教廷參與34個國際組織（機構）及國際計畫，其中19個屬觀察員性質，另梵蒂岡城國（The Vatican City State）為7個國際組織會員。
